Inicialmente Capela de Nossa Senhora do Terço, a Igreja da Ordem Terceira de São Francisco de Chagas é, hoje, o mais antigo edifício da cidade. O templo foi concluído em 1738 e em 1752 foi doada à Ordem dos Franciscanos da Província do Rio de Janeiro com a condição de que, junto a ela, construíssem um hospício e dessem sepultura aos doadores e seus descendentes.

Em 1835 o vigamento desabou e no final da década de 1870 a igreja passou por uma recuperação que refez a fachada, teto, telhado, forro, assoalho, vigamento e presbitério, aproveitando os materiais e objetos da antiga matriz, demolida anos antes. A Igreja da Ordem foi inaugurada então em 1980, mas devido às obras o templo já havia sido fortemente descaracterizado.